女性重度抑郁障碍circRNA-miRNA网络相关性及调控机制分析

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摘要 摘要目的基于高通量测序技术获得女性重度抑郁障碍患者外周血差异circRNAs和miRNAs表达谱,进而构建互作网络,再通过功能注释和通路富集分析探索女性抑郁障碍可能存在的发生发展机制。方法依据ceRNA理论,运用TargetScan软件预测相结合位点,进而构建circRNA-miRNA网络。再对共表达miRNA的靶基因进行预测并进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,进而筛选出与抑郁障碍相关的关键基因。结果差异circRNAs共724个;差异miRNAs共26个。hsa_circ_0086092和hsa-miR-146a-3p分别是共表达最高的circRNA和miRNA。GO功能分析显示主要包括含核碱基的化合物代谢过程的调控、RNA剪接的调控、细胞通讯调节、氨基酸转运、RNA代谢过程的调控和信号调节等生物学过程。KEGG通路分析显示靶基因主要富集在神经营养蛋白信号通路、Rap1信号通路、FoxO信号通路、AMPK信号通路、可卡因成瘾、mTOR信号通路、Jak-STAT信号通路、cAMP信号通路等。预测的靶基因中BDNF、FGF2、MAPK14、GRIN2A、GRIN2B、GRM2和PDE4与抑郁障碍相关度最高。结论hsa_circ_0086092可能通过与hsa-miR-146a-3p的相互作用参与女性重度抑郁障碍的发生发展。
出版日期 2020年12月20日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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