摘要
目的建立椰毒假单胞菌酵米面亚种荧光标记扩增片段长度多态性（FAFLP）分型方法,并对4株模式菌株和19株分离菌株进行分型。方法选用4种低频限制性内切酶（ApaⅠ、EcoRⅠ、HindⅢ和PstⅠ）和2种高频限制性内切酶（MseⅠ和TaqⅠ）进行组合,对FAFLP预扩增和选择性扩增体系进行优化,用BioNumerics软件对分离株的指纹图谱进行聚类分析,并与VITEK2GN生化结果和16SrDNA序列分析进行比较。结果ApaⅠ-G/TaqⅠ-G组合将19株椰毒假单胞菌酵米面亚种分为7个群,菌株间最低相似度为80.85%,最高相似度为98.77%。PstⅠ-T/TaqⅠ-G组合将19株椰毒假单胞菌酵米面亚种分为10个群,菌株间最低相似度为48.68%,最高相似度为99.67%。两种FAFLP组合均能将菌株进行完全区分,而VITEK2GN和16SrDNA序列分析无法将菌株进行完全区分。结论ApaⅠ-G/TaqⅠ-G组合与PstⅠ-T/TaqⅠ-G组合FAFLP对椰毒假单胞菌酵米面亚种具有足够的分辨率,本研究建立的FAFLP分型方法可应用于椰毒假单胞菌酵米面亚种的分子分型和溯源。
出版日期
2013年02月12日（中国期刊网平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
