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水生生物DNA序列相似度的算法

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摘要本文提出DNA序列相似度指标,建立DNA序列比对算法。首先,将水生生物DNA样本序列与现有的基因库中的DNA序列逐项比对;其次,在满足特定阈值条件下,确认样本序列的分类。利用Java编程语言来实现算法,通过MonteCarlo模拟和实际应用,验证算法的有效性。理论结果表明：在满足特定阈值条件下,通过计算DNA序列相似度,能够确定数据库中与未知DNA样本序列最相似的序列,判断样本序列的分类。模拟实验、对比研究和应用结果表明：相似度指标算法在有效判别DNA序列的分类,提高DNA序列匹配成功率,降低程序复杂度等方面具有优良特征。

DOI g4q1orqzd8/1668272

作者于喆

机构地区不详

出处《水产学杂志》 2016年5期

关键词 DNA序列相似度指标水生生物 MONTECARLO模拟

分类 [农业科学][水产科学]

出版日期 2016年05月15日（中国期刊网平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）