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间隔臂和探针长度与寡核苷酸芯片重复性相关性研究

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摘要研究寡核苷酸芯片的重复性与间隔臂(spacer)和探针长度之间的相关性.设计12条不同长度的带有不同spacer的探针,与749bp荧光标记靶序列杂交.扫描分析三次杂交结果,用Quantarray定量分析软件进行分析.随探针长度的延长,杂交信号的变异系数逐步降低.15mer的探针杂交的信号较弱,杂交不够稳定,重复性也相对较差.20mer、25mer、30mer的探针的变异系数逐渐降低.spacer为15时变异系数最小.说明选择spacer为poly(dT)15的25mer和30mer的探针可以获得较好的重复性.

DOI ojzzprqyj5/2045294

作者潘继红;韩金祥

机构地区不详

出处《生物技术通讯》 2003年1期

关键词间隔臂探针长度寡核苷酸芯片相关性杂交重复性变异系数

分类 [生物学][生物工程]

出版日期 2003年01月11日（中国期刊网平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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来源期刊

生物技术通讯

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