简介：摘要视网膜由多类细胞组成，每类细胞都有着独特的生物学功能。即使是同类细胞，也会因遗传异质性导致细胞功能出现差异。以往传统的研究手段无法分辨这些差异，有些细胞由于缺乏特异性分子标记或数量稀缺也难以定义，阻碍了人们对这些细胞的认识及研究。随着生物技术的发展，单细胞转录组测序技术可以获得单个细胞转录组表达谱、识别细胞间异质性、鉴别细胞亚类及稀有细胞群，揭示每个细胞的转录组表达谱特征和功能差异，剖析细胞的起源、功能及变异特征。可获得与疾病相关的特征性细胞亚类及特异性差异表达基因，加深我们对疾病起因、发展的理解，也为临床诊断及靶向治疗提供帮助。

简介：摘要近年来，新型冠状病毒肺炎、流行性感冒、埃博拉出血热等病毒性疾病呈现愈演愈烈、愈发愈快的趋势。为保障人民健康和国民经济的稳定运行，研究病毒的致病机理与宿主免疫调控机制，解析病毒与宿主的基因表达调控规律，监测病原病毒与防治病毒病的重要性逐渐凸显。转录组测序是一类在RNA水平上关注基因在特定时空状态下表达特征的技术，是分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。随着分子生物学实验技术的进步和生物信息学分析平台的成熟，转录组学研究向着低成本、低技术门槛的方向发展，逐渐从理论研究领域向临床实验室过渡，改变着临床工作人员对病毒与病毒病的传统认知，被越来越多的用于病毒转录机制、病毒与宿主的免疫互作、追踪疾病进展以及抗病毒药物研发等方面研究。本文主要对宏转录组的技术流程、常用软件以及病毒与病毒病方向的应用场景进行综述，并对细胞群转录组、单细胞转录组、单细胞核转录组以及空间转录组的方法与应用进行简要介绍，以期为病毒转录机制研究与病毒病的防控提供方法学参考。

简介：摘要目的探索转录因子（transcription factors, TFs）和结肠癌预后的联系，通过TCGA和GEO双数据库构建预后模型，从而量化患者的风险并指导临床治疗决策。方法本研究运用TCGA和GEO数据库中结肠癌的转录组和临床数据，先将转录组数据进行基因注释并计算基因表达量，对TCGA和GEO中TFs行差异性分析（| log2FC| >1，P-Value（Fdr）<0.05）。取双数据交集的差异TFs行相关预后分析（P<0.01）。利用COX多因素分析计算出预后相关TFs的风险系数和其风险值，应用"survival"和"glmnet"包进行COX模型构建TFs预后模型。绘制出序列集和验证集的生存曲线（P<0.001）及ROC曲线（AUC>0.75），对风险值的分布进行可视化。按风险值分组后计算GSEA富集分析，构建基因集网格，进行靶基因预测，最后进行GO和KEGG的通路富集分析。结果取TCGA和GEO数据库两者交集的387个表达差异的TFs绘制热图，火山图及TFs相关的森林图，按照COX多因素分析构建出结肠癌预后模型=0.310×HSF4+0.137×IRX3-0.127× ATOH1+0.290×OVOL3+0.137×HOXC6+0.155×SIX2+0.092×ZNF556-0.444×CXXC5+0.429×TIGD1+0.413×TCF7L1。通过富集分析，结果显示这些预后因子可能直接或间接作用于癌通路，如基础细胞癌与癌症信号通路、局部组织与细胞黏附及细胞外基质等。结论构建的TFs对结肠癌预后模型可量化结肠癌预后风险，其高风险组是结肠癌预后的独立风险因素，该模型是一种评估结肠癌预后的新方式。

简介：叉头框蛋白O（FoxO）转录因子属于叉头框蛋白家族的一个亚类,可在慢性炎症反应中参与骨耦联、溶骨性病损的形成以及骨代谢平衡的体内调控。慢性根尖周炎是发生在牙齿根尖周组织的慢性炎症性疾病,可引起根尖周骨质丧失,研究FoxO转录因子在骨代谢中的作用和相关机制,对于为慢性根尖周炎寻求新的治疗途径具有重要意义。本文就FoxO转录因子对细胞增殖与凋亡、成骨分化的调节作用,以及与炎症、炎症因子、氧化应激间的关系进行综述。

简介：WRKY转录因子是高等植物中最重要的转录因子基因家族之一,在植物应对生物胁迫(病原菌和病毒等)和非生物胁迫(干旱,盐害,冷害和热害等)等一系列逆境应答进程中发挥重要作用。目前高等植物中WRKY转录因子在调控植物应答生物胁迫和非生物胁迫中的相关功能进行了总结。在目前已经报道的WRKY转录因子功能基础上,分析了不同植物中WRKY转录因子的的逆境应答模式和功能特征,为未来探索作物WRKY转录因子的逆境应答调控机理奠定基础。

简介：为了找出差异基因用于高油酸油菜育种，对两个油酸含量不同的高油酸油菜材料（油酸含量分别为84．4％和56.2%）成熟期种子进行转录组分析和实时荧光定量PCR分析。IlluminaHiseq，M2000测序得到8．09Gbcleanreads，组成52361个unigene，平均长度为659bp。比对公共数据库得到48911f93．41％）个氨基酸序列。鉴定出6414个在高油酸油菜和低油酸油菜中差异显著的基因，这些基因有1296个在高油酸油菜中上调表达（20．21％），5118个下调表达（79．79％），共有2043个差异基因在119个代谢通路中富集表达。将其中14个与脂肪酸代谢和光合作用相关基因进行荧光定量PCR验证。Bna0799930，Bna0104450和Bna0305890在高油酸油菜中上调表达，其余的下调表达。Bna0501620，Bna0391450和Bna0084310在高油酸油菜中的表达量超过低油酸油菜中表达量2倍以上，分别为4．48倍，4．21倍和2．26倍。这些新发现的差异基因可用于高油酸油菜分子育种研究。

简介：2007年底，南阳市实施机关公务员制度改革，需对全市机关干部重新进行身份确认。为了做好这项工作和应对即将到来的查档高峰，南阳市档案馆把其作为整合馆藏民生档案的切入点，以最快速度建立了涉及全市39042名干部转录聘干情况的专题数据库，并据此编辑出版了两册103万字的精装本《南阳市转录聘干名录》，受到了市委、市政府和各级组织人事部门的好评，并产生了可观的经济效益。

简介：摘要近年来转录组测序（RNA-seq）技术的成熟和推广应用，为直接测序和鉴定各种可能发生的融合转录本提供了强大工具。随着大宗病例RNA-seq研究报道的增多，血液肿瘤中融合基因的真实图谱日渐清晰。文章结合第62届美国血液学会年会的报道对相关研究进展进行介绍。

简介：转录因子是一种DNA结合蛋白,通过与真核基因启动子区域中的顺式作用元件发生特异性相互作用来调控基因的转录.DREB（与干旱应答元件结合的）转录因子是一类新发现的植物特有的转录因子,能够特异地识别DRE（干旱应答元件）顺式作用元件并与之发生作用,从而激活植物体内一系列逆境应答基因的表达.本文综述了近几年在DREB转录因子的结构、功能、表达调控以及应用方面的研究进展.

简介：DVDRip格式的视频相信不少朋友电脑里都有，而且遇到一些经典的还想长期保存。但是无奈不少DVDRip格式的视频个头都比较大，面对一天天减少的硬盘空间，又不得不删除部分心爱的视频，这个时候真是可以用心如刀割来形容，那有没有既不用删除视频，又能节约硬盘空间的方法呢？当然，只要把DVDRip格式的视频转换成VCD格式，这样不仅能让视频减肥，还能把这些视频记录成盘，在VCD，DVD机上播放。

简介：摘要番茄是最重要的蔬菜作物之一。该文围绕转录组学的研究方法、转录组学在番茄果实发育、繁殖机制以及抗病虫害等方面的研究进行了综述，旨在揭示植物生长与发育的基本生物学问题以及促进其在生产中的应用。

简介：摘要TBX3基因其转录调控因子在脊椎动物和非脊椎动物的器官发生和形态发生学方面有至关重要的作用，TBX3基因在细胞周期调控、细胞凋亡和肿瘤发生中也发挥着重要的作用1，本文将从TBX3的基本结构、生物学功能、表达调控等方面进行综述。

简介：考虑生物生长过程中受到的不可预知的跳跃性的环境扰动，运用一类非高斯噪声建立了随机的基因转录调控系统．利用MonteCarlo法得到了系统的稳态概率密度函数，研究了非高斯噪声的各个参数对蛋白质浓度的影响，发现噪声强度不能够诱导基因开关，而稳定为基因开关的控制参量．进一步研究了非高斯噪声作用下系统从一个态跃迁到另一个态的平均首通时间（MFPT），并讨论了各个参数不同的作用机理

简介：Survivin基因作为目前所发现的最强的凋亡抑制基因,具有强大的抗凋亡和调控细胞周期作用,并异常高表达于大部分肿瘤组织,显示出与肿瘤发生、发展及预后密切相关。

简介：【摘要】转录组测序（RNA-seq）是生物医学研究的重要手段之一，对数据进行质量控制，剔除质量异常样本，是保证生物学结果准确的必要前提。然而，现有的质量控制工具都局限于单个样本或单一数据层面，不利于分析人员多角度发现异常样本。本研究基于R语言开发了RawdataQC软件包，可以在原始数据、比对数据和基因表达谱三个层面对多个样本进行质量控制；通过可视化方法，帮助使用者综合多个数据层面发现低质量样本。本研究将助力广大临床医生和研究者开展转录组数据质量控制，为生物学结果准确提供质量保证。

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简介：表达的冲动，无时无刻不像大海的波浪一样撞击着我们每个人的心灵：表达的冲动、无时无刻不像暴涨的江水一样随时都准备着决堤而出：表达的冲动、无时无刻不像挂在我们心中的一串等待着风儿掠过的风铃……

简介：当你欣喜若狂的时候,你用欢呼来表达;当你悲痛欲绝的时候,你用眼泪来表达;当你怒发冲冠的时候,你用拍遍栏杆、仰天长啸来表达;当你静默沉思的时候,你用闲庭信步、面壁独语来表达。表达,维系着人与人之间的语言;表达,传递着我们和世界之间的各种信息;表达,成了我们向自己和世界证明的一种重要方式。我们每天都在面对表达,犹如我们每天都在呼吸空气。从婴儿落地的第一声啼哭

简介：摘要目的探讨B组链球菌（GBS）阳性的早产孕妇中白细胞介素6（IL-6）和磷酸化信号转导及转录活化因子3（p-STAT3）的表达及其与早产的关系。方法选择深圳市福田区妇幼保健院2018年6月至2019年6月门诊产前检查至住院待产的孕妇1 950例中GBS阳性者共122例。对GBS阳性早产20例（早产组）、足月胎膜早破者33例（胎膜早破组）、足月阴道分娩孕妇66例（足月分娩组）、流产3例（流产组）及同期GBS阴性孕妇20例（GBS阴性对照组）的阴道分泌物制备悬浮液，采用ELISA法检测IL-6浓度，Western blot检测p-STAT3、p-Akt和NF-κB亚基p65的表达。结果入组孕妇GBS阳性率为6.25%（122/1 950），其中流产、早产、足月胎膜早破和足月分娩孕妇分别占2.45%（3/122）、16.12%（20/122）、26.62%（33/122）和53.66%（66/122）。GBS阳性早产组孕妇IL-6表达[（0.065 ± 0.034）pg/ml]显著高于GBS阳性足月产者[（0.045 ± 0.021）pg/ml]（t =－3.192、P = 0.002）和GBS阴性者[（0.043 ± 0.020）pg/ml]（t =－2.494、P = 0.017），差异均有统计学意义。p-STAT3在GBS阳性早产病例中的表达（灰度值：0.06 ± 0.03）显著高于GBS阴性对照组（灰度值：0.04 ± 0.01），差异有统计学意义（t =－2.981、P = 0.005）；GBS阳性早产组和GBS阴性对照组p-Akt灰度值分别为（0.035 ± 0.02）和（0.07 ± 0.03），差异有统计学意义（t = 4.341、P = 0.001）；p65灰度值分别为（0.045 ± 0.02）和（0.085 ± 0.04），差异有统计学意义（t = 4.000、P = 0.003）。结论GBS阳性病例早产可能与阴道分泌物中IL-6、p-STAT3、p-Akt和p65高表达有密切关系。