简介：【摘要】目的 围绕药品检测环境微生物，采用多种测序技术对其实施鉴定分析，评定其应用价值。方法 以药品微生物实验室为对象，采集、收集其环境当中的细菌（248株）、霉菌（6株），实施鉴定操作（全自动微生物生化鉴定仪）。依据所得到的生化鉴定结果，基于种属分类学，选择20种具有代表性的细菌（28株）与霉菌（6株），分别用宏基因组测序技术（Hiseq2000与Ion torrent测序平台）、一代测序技术（基于ABI3500测序平台）实施鉴定分析，对菌株鉴定方法所具有的准确性进行相互验证。结果 在28株细菌当中，较之生化鉴定，16SrDNA一代测序鉴定有23株属水平分类一致，10株种水平分类一致。用Hiseq2000对细菌混合实施全基因测序鉴定，较之16SrDNA一代测序，15株种水平一致，2株属水平一致；针对霉菌全基因组测序而言，得到菌信息3株，相比于一代测序结果（霉菌LSU rDNA），3株菌信息缺失。用Ion torrent开展16S rDNA宏基因组测序鉴定，与16S rDNA一代测序结果相比较，有11种对应，且10种属对一代测序当中的28株菌进行了覆盖。结论 针对新一代的宏基因组测序技术及配套的分析方法而言，需持续健全与优化，方能快速、准确的对环境微生物混合菌株实施鉴定，更好的实施建库溯源工作。

简介：【摘要】目的 围绕药品检测环境微生物，采用多种测序技术对其实施鉴定分析，评定其应用价值。方法 以药品微生物实验室为对象，采集、收集其环境当中的细菌（248株）、霉菌（6株），实施鉴定操作（全自动微生物生化鉴定仪）。依据所得到的生化鉴定结果，基于种属分类学，选择20种具有代表性的细菌（28株）与霉菌（6株），分别用宏基因组测序技术（Hiseq2000与Ion torrent测序平台）、一代测序技术（基于ABI3500测序平台）实施鉴定分析，对菌株鉴定方法所具有的准确性进行相互验证。结果 在28株细菌当中，较之生化鉴定，16SrDNA一代测序鉴定有23株属水平分类一致，10株种水平分类一致。用Hiseq2000对细菌混合实施全基因测序鉴定，较之16SrDNA一代测序，15株种水平一致，2株属水平一致；针对霉菌全基因组测序而言，得到菌信息3株，相比于一代测序结果（霉菌LSU rDNA），3株菌信息缺失。用Ion torrent开展16S rDNA宏基因组测序鉴定，与16S rDNA一代测序结果相比较，有11种对应，且10种属对一代测序当中的28株菌进行了覆盖。结论 针对新一代的宏基因组测序技术及配套的分析方法而言，需持续健全与优化，方能快速、准确的对环境微生物混合菌株实施鉴定，更好的实施建库溯源工作。