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Fluorescence-based Multiplex PCR-Single Strand Conformation Polymorphism （SSCP） Analysis of 16S Ribosomal DNA Using Capillary Electrophoresis

简介：TherRNAgeneticlocusisfoundinallprokaryoticorganisms,andishighlyconservative,althoughitsrelativelystablevariationsarefoundfrequentlyindifferentbacteria.Theutilityofthislocusasataxonomicandphylogenetictoolhasbeenreportedwidely.Thisstudy,aimedat16SrRNAgene(16SrDNA)andwiththehelpofbiomolecularmethods,attemptedtoachievethegoalofrapididentificationofcommonpathogensInthisstudy,333clinicalisolatedpathogenicbacteriawerecollected。TwopairsofprimerswerechosenandlabeledwithdifferentfluorescentdyesandthenusedtoamplifythegenomicDNAextractedfrombacteria.ThePCRproductswerethendetectedbycapillaryelectrophoresis-singlestrandconformationpolymorphism(CE-SSCP).Inordertopursuehigherresolutionandpeak-separationeffect,ahighefficientseparatingmedium,linerpolyacrylamidedel(LPA),wasputtouseinthisstudy.Finally,everybacteriacolonygenerateddistinctpatternsfromeachother,whichwereeasilytobeusedforidentification.TheseresultsindicatedthatPCR-CE-SSCPwasarapididentificationmethodforbacterialidentification,withtheaspectsofhighefficiencyandhighprecision.Comparedwithtraditionalmethod,thistechnologyisofgreatutilityforclinicaluseespeciallyforitshighsensitivity.
标签：毛细电泳细菌检测检测方法 DNA 荧光 PCR

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