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  • 简介:双向强风是一条简单途径检测,注解,并且分析候选人orthologous或在一个单身者的paralogous序列去。这个过程通常被限制到设定的Perl脚本的领域,通常为象UNIX一样调节了环境。移植那些脚本到另外的操作系统涉及重新分解他们,并且另外有要求的图书馆的Perl编程环境的安装。克服这些限制,一条数据管道在Java被实现。这应用提交序列的二批到NCBI强风工具的本地版本,管理结果表,并且精制双向、简单的点击。变细长术语被纳入点击,几统计被导出,并且分子的进化率通过PAML被估计。结果被写给为进一步的分析打算的一套限定的文章表格。提供的图形的用户接口用这个应用程序允许一个友好相互作用,它被记录并且对在http://moodle.fct.unl.pt/course/view.php的下载可得到?在GNUGPL许可证下面的id=2079或https://sourceforge.net/projects/bidiblast/。

  • 标签: 数据管道 比较基因组学 UNIX环境 PC 分子进化速率 图形用户界面