简介：Circulargenomes,beingthelargestproportionofsequencedgenomes,playanimportantroleingenomeanalysis.However,traditional2Dcircularmaponlyprovidesanoverviewandannotationsofgenomebutdoesnotofferfeature-basedcomparison.Forremedyingtheseshortcomings,wedeveloped3DGenomeTuner,ahybridofcircularmapandcomparativemaptools.Itscapabilityofviewingcomparisonsbetweenmultiplecircularmapsina3Dspaceoffersgreatbenefitstothestudyofcomparativegenomics.Theprogramisfreelyavailable(underanLGPLlicence)athttp://sourceforge.net/projects/dgenometuner.

简介：

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简介：Ithasbeenshownthattheprogressinthedeterminationofmembraneproteinstructuregrowsexponentially,withapproximatelythesamegrowthrateasthatofthewater-solubleproteins.Inordertoinvestigatetheeffectofthis,ontheperformanceofpredictionalgorithmsforbothα-helicalandβ-barrelmembraneproteins,weconductedaprospectivestudybasedonhistoricalrecords.WetrainedseparatehiddenMarkovmodelswithdifferentsizedtrainingsetsandevaluatedtheirperformanceontopologypredictionforthetwoclassesoftransmembraneproteins.Weshowthattheexistingtop-scoringalgorithmsforpredictingthetransmembranesegmentsofα-helicalmembraneproteinsperformslightlybetterthanthatofβ-barreloutermembraneproteinsinallmeasuresofaccuracy.Withthesamerationale,ameta-analysisoftheperformanceofthesecondarystructurepredictionalgorithmsindicatesthatexistingalgorithmictechniquescannotbefurtherimprovedbyjustaddingmorenon-homologoussequencestothetrainingsets.Theupperlimitforsecondarystructurepredictionisestimatedtobenomorethan70%and80%ofcorrectlypredictedresiduesforsinglesequencebasedmethodsandmultiplesequencebasedones,respectively.Therefore,weshouldconcentrateoureffortsonutilizingnewtechniquesforthedevelopmentofevenbetterscoringpredictors.

简介：C3d是补体C3不可再被酶解的最小片段,在抗原特异性免疫建立之前,C3d可识别非己抗原并与之共价结合,增强了抗原递呈细胞的递呈能力、降低了B细胞的活化阈、提高特异性抗体的滴度、促进抗体亲和力成熟等.近年来研究显示,C3d还可以促进抗原特异性细胞免疫应答水平并改变机体免疫应答模式.所以,C3d是连接固有性免疫和获得性免疫的桥梁.本文对C3d的分子生物学特征、生物学功能以及作为分子佐剂可能的分子机制进行了简要总结.

简介：以便获得米饭幼仔圆锥花序proteome的高分辨率的electrophorogram，我们评估了通常使用在的各种各样的协议二维(2D)蛋白质的polyacrylamide胶化电气泳动(页)包括染色协议的胶化，使不能调动的pH坡度(IPG)的pH范围脱衣并且样品装载数量。结果证明染色协议使用的银敏化包含冰川的醋酸，钠醋酸盐和钠thiosulfate的答案(在1988由Heukeshoven和Dernick报导了)并且染色方法使用答案包含的Coomassie灿烂的蓝色G-250，铵硫酸盐和磷的酸(在2010由粉红色的等报导了)表明了优异染色效果。另外，当有5-8的pH范围的IPG胶化长带被使用时，我们也与4-7的pH范围证明更高的分辨率被完成，与那相比。最后，最佳的装载数量作为与染色协议的银硝酸盐在联合与pH5-8使用17厘米长的非线性的IPG长带的130g被决定。评估结果将在年轻米饭颖果的proteome分析是有用的。

简介：目的探讨血浆（1—3）-β-D-葡聚糖对早期诊断深部真菌感染的临床价值。方法收集2009年3月-11月间在北京友谊医院感染科住院患者174例，根据侵袭性真菌感染诊断标准，将患者分为排除深部真菌组、确诊组、临床诊断组、拟诊组。应用MB-80微生物动态快速检测系统，检测各组患者血浆（1—3）-β—D-葡聚糖水平，分析比较深部真菌感染组和非深部真菌感染组血浆（1-3）-β-D-葡聚糖的水平。结果深部真菌感染组血清（1-3）-β-D-葡聚糖含量为（153．4±37．0）pg／mL，排除深部真菌感染组血清（1-3）-β—D-葡聚糖含量为（54．6±8．6）pg／mL，两组间有统计学差异（t=3．4，P〈0．01）；分析血浆（1-3）-β-D-葡聚糖诊断深部真菌感染，以20pg／mL为诊断阈值，其准确率、敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别为70．1％、87．5％、61．9％、52．1％、91．2％。确诊病例、临床诊断病例、拟诊病例，3组间血清（1—3）-β-D-葡聚糖含量无统计学差异（P〉0．05）。结论深部真菌感染组的葡聚糖水平明显高于排除深部真菌感染组的葡聚糖水平，具有统计学意义。以20pg／mL为诊断阈值，其准确率、敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别为70．1％、87．5％、61．9％、52．1％、91．2％，可作为深部真菌感染的最佳诊断阈值。

简介：目的探讨血液细菌感染对血清(1,3)-β-D-葡聚糖检测结果的影响。方法排除影响G试验结果的干扰因素后,选取符合入组条件的血培养细菌阳性及血培养阴性患者各40例,采集血清进行G试验检测。结果40例血培养细菌阳性标本中革兰阳性菌22例,革兰阴性菌18例,其中只有1例大肠埃希菌的G试验结果为阳性,4例在灰区,其余为阴性。40例血培养阴性标本3例G试验结果在灰区,其余为阴性。血培养细菌阳性组与血培养阴性组G试验结果差异无统计学意义(P>0.05)。结论血液细菌感染对G试验检测干扰较小。

简介：目的探讨血浆（1-3）-β-D葡聚糖（即G实验）对院内侵袭性真菌感染的临床价值。方法选择2016.11~2017.4在宁夏医科大学总医院住院患者中院内侵袭性真菌感染的高危患者132例,血浆（1-3）-β-D葡聚糖含量使用MB-80微生物快速检测动态系统及其试剂进行检测,用ROC曲线比较G实验、真菌培养、G实验联合真菌培养的检测结果。结果132例高危院内IFI感染的患者中,共有43例诊断为院内侵袭性真菌感染,真菌培养的敏感度为67%,特异度为96%,阳性预测值（PPV）和阴性预测值（NPV）分别是0.72和0.80,G实验的敏感度为70%,特异度为88%,PPV和NPV分别是0.73和0.86;G实验真菌培养检测的敏感度提高为84%,特异度提高为92%,阳性预测值0.78,阴性预测值0.92;G实验Youden指数0.58,真菌培养Youden指数0.63,联合检测Youden指数提高到0.76;G实验结果、真菌培养结果及联合检测结果进行ROC曲线分析,曲线下面积分别为0.717,0.757及0.798。结论G实验是一种快速、简便、实用的侵袭性真菌感染的早期诊断方法,联合传统真菌培养可提高诊断的敏感度、特异度及诊断价值。

简介：目的探讨（1,3）-β-D-葡聚糖检测（G试验）在侵袭性真菌病诊断中的价值。方法回顾性研究重庆医科大学附属第一医院2014年1~6月间临床G试验的住院患者结果,分析G试验诊断真菌感染的敏感性、特异性、符合率、阳性预测值、阴性预测值、约登指数等能力指标。结果真菌感染组G试验检测值228.4±250.1pg/mL,非真菌感染组G试验检测值32.6±13.6pg/mL,两组间有显著统计学差异（P〈0.001）;G试验对真菌感染的敏感性、特异性、符合率、阳性预测值、阴性预测值、约登指数分别为83%、92%、88%、89%、87%、0.75。结论G试验是真菌感染的重要早期实验室指标之一,对其合理应用可有效提高真菌感染的诊治水平,特别是阴性结果对排除真菌感染的意义更大。

简介：据国外媒体1月29日报道。最新研究显示，维生素D或能缓解哮喘症状，体内维生素D含量不足的患者，哮喘症状更严重。

简介：【背景】2，4-D二甲胺盐是一种选择内吸性除草剂，用于清除果园、牧场、水域等环境中的藜、苋等阔叶杂草。本文明确了2，4-D二甲胺盐在防除鱼塘杂草过程中对淡水鱼类的毒性。【方法】采用半静态法测试了2，4-D二甲胺盐对草鱼、鲢鱼和鲫鱼的急性毒性，并明确了2，4-D二甲胺盐对草鱼、鲢鱼和鲫鱼的安全浓度。【结果】随着供试鱼苗在药液中暴露时间的延长，LC50。值逐渐减小。2，4-D二甲胺盐对草鱼、鲢鱼和鲫鱼的96hLC50值分别为369．27、339．20和438．47mg·L^-1。2，4-D二甲胺盐对草鱼、鲢鱼和鲫鱼的安全浓度分别为36．93、33．92和43．85mg·L^-1。【结论与意义】2，4-D二甲胺盐对草鱼、鲢鱼和鲫鱼表现低毒。本研究为合理使用2，4一D二甲胺盐防除水生杂草提供了依据。

简介：目的探讨应用高脂饮食建立慢性系膜增殖性肾炎血管病变模型的方法。方法雄性Wistar大鼠行单侧肾切除后随机分为单纯肾切除组、单纯肾炎组、单纯高脂组、肾炎高脂组。单纯肾炎组、肾炎高脂组在单侧肾切除后3d尾静脉注射OX7抗体（100mg/kg）,1周后尾静脉连续注射OX7抗体（每次100mg/kg,1次/周,共3次）,单纯肾切除组和单纯高脂组在同一时间尾静脉注射PBS,注射抗体后第2天单纯高脂组、肾炎高脂组腹腔注射维生素D3（6万U/kg,1次/4周）,同时给予高脂饲料。分别于第4、8、10周观察各组大鼠的一般情况、体重、血压、尿蛋白、血浆白蛋白、血脂、血钙、肾功能以及肾脏病理改变。结果模型组（肾炎高脂组）大鼠第8周肾小球外的小动脉出现管壁增厚,管腔变小,平滑肌细胞减少,细胞排列紊乱,纤维组织增生。第10周单纯肾炎组和单纯高脂组肾小球外小动脉管壁轻度增厚,管腔变化不明显,模型组血管病变积分明显高于单纯肾炎组和单纯高脂组（P〈0.05）。结论通过对慢性抗Thy1肾炎大鼠加用高脂饲料并腹腔注射维生素D3的方法,可以成功建立慢性系膜增殖性肾炎血管病变模型。

简介：在植物昆虫相互作用的偏爱表演关系是在进化生态学的一个中央主题。在许多昆虫之中，鸡蛋是脆弱的，幼虫限制了活动性，使一个适当oviposition地点的选择成为为女性的最重要的决定之一。我们由人工地为2个自然资源，葡萄和植物的一种为偏爱选择在果蝇melanogasterMeigen和果蝇simulansSturtevant调查了oviposition偏爱的进化。我们的学习的主要发现是D的微分回答。melanogaster和D。simulans。尽管偏爱在D的试验性的人口演变。melanogaster，回答不与政体使用了的选择一致。相反，在D的回答。simulans与期望一致，证明这种有为特点的可选的基因变化。而且，在D之间交叉。simulans分叉的线证明涉及葡萄偏爱的基因因素看起来大部分后退。在摘要，我们的人工的选择学习建议那D。melanogaster和D。simulans为这个特点拥有不同基因体系结构。

简介：CellsregulatephospholipaseD(PLD)activityinresponsetonumerousextracellularsignals.Here,weinvestigatedtheinvolvementofPLDactivityintransforminggrowthfactor-β(TGF-β1)-mediatedgrowthinhibitionofepithelialcells.TGF-β1)-mediatedgrowthinhibitionofepithelialcells.TGF-β1inhibitsthegrowthofMDCK,Mv1Lu,andA-549cells.Inthepresenceof0.4%butanol,TGF-β1inducesanincreaseintheformationofphosphatidylbutanol,auniqueproductcatalyzedbyPLD.TGF-β1alsoinducesanincreaseinphosphatidicacid(PA)levelinA-549andMDCKcells.TGF-β1inducesanincreaseinthelevelsofDAGlabeledwith[^3H]-myristicacidinA-549andMDCKcellsbutnotinMv1Lucells.NoincreaseofDAGwasobservedincellsprelabeledwith[^3H]-arachidonicacid.ThedatapresentedsuggestthatPLDactivationisinvolvedintheTGF-β1-inducedcellgrowthinhibition.

简介：目的探讨（1,3）-β-D-葡聚糖检测和半乳甘露聚糖抗原检测在侵袭性真菌病诊断中的价值。方法回顾性研究北京大学第一医院2008年1月~2010年7月临床疑诊侵袭性真菌病的住院患者。根据诊断标准确定是否诊断侵袭性真菌病。分析非培养诊断方法血清半乳甘露聚糖（GM试验）和血浆（1,3）-β-D-葡聚糖（G试验）的敏感度和特异度,以及二者联合应用后诊断的敏感度和特异度。结果GM试验灵敏度为70%,特异度为84%;G试验灵敏度为50%,特异度为92%。GM试验和G试验二者联合试验时,其灵敏度和特异度分别为93%和78%。结论GM试验和G试验均对侵袭性真菌病具有诊断价值,二者联合应用使其应用价值进一步提高。

简介：Amurinemacrophage-likecelllineJ774,acquired,inresponsetoLPS,anabilitytokilltumornecrosisfactor(TNF)-insensitivetargetP815mastocytomacellswhereasanothercellline,P388D1didnot,LPStriggeredsignalingmechanismsbetweenthetwocelllineswerecomparedwithanaimtoinquireaboutthepossiblenatureoftheabove-mentioneddifference,TheresultswhowedthattwocelllinesrespondtoLPS-treatmentbyparallelactivationofbothphospholipasesCandA2(PLCandPLA2)toapproximatelythesameextent.ThemaximumresponseoftothenzymesofJ774cellswasnotedwithin10minthetreatmentwhereasthatofP388D1cellsrequiredmorethan20min,TheotherpropertiesofLPS-responsiveenzymesstudiedweresimilarbetweentwocelllines,includingActivationofPLCandPLA2andPKCinmacrophagesbyLPS.Ca2+augmentationofenzymeactivation,participationofguaninenucleotidebinding(G)proteinsintheinitialactivationpreocesses,andinhibitionofenzymeactivationbythepriortreatmentofcellswithcholeraorpertussistoxinsetc.Moreover,LPS-triggeredactivationofPLCandPLA2wasfoundtobefollowedbytheincreaseofPKCactivitiesinbothcelllines.Inspiteofthesesimilarities.J774cellspossessedbothbasicandacidicformsofPKCactivities,whileP388D1cellsownedonlyPKCofbasicform,Nevertheless,thequestionwhyJ774cellsbutnotP388D1cells,canacquirethetumoricidalactivity,aganistP815,cellsfollowingLPStreatmentrematinstobeanswered.

简介：水稻在抽穗开花期对高温胁迫非常敏感,通过挖掘耐热资源,培育耐热水稻品种是应对高温热害最有效的方式。前期研究发现,地方稻资源D43在花期连续高温条件下能保持较高的结实率。本研究在大田和人工气候室不同高温处理下,分析了D43的开花时间与耐热性之间的相互关系。结果表明,高温能够使水稻的开花时间提前,D43表现出稳定的早花时特性,高温胁迫下的开花时间集中在8∶30~10∶00;在开花时间段恒定高温胁迫下,D43的结实率较低;但在大田高温和人工气候室模拟高温胁迫下,D43的开花时间避开了日高温段,从而表现出较高的结实率;花器官形态性状包括花药开裂率、柱头上的花粉附着数、花粉萌发数与结实率之间呈显著正相关,因此可用于评价水稻的花期耐热性。

简介：Amurinemacrophage-likecellline,J774,acquried,inresponsetoLPS,anabilitytokilltumornecrosisfactor（TNF）-insensitivetargetP815mastocytomacells,whereasanothercellline,P388D1,didnot.LPS-triggeredsignalingmechanismsbetweenthetwocelllineswerecomparedwithanaimtoinquireaboutthepossiblenatureoftheabove-mentioneddifference.TheresultsshowedthattwocelllinesrespondtoLPS-treatmentbyparallelactivationofbothphospholipasesCandA2（PLCandPLA2）toapproximatelythesameextent.ThemaximumresponseofbothenzymesofJ774cellswasnotedwithin10minofthetreatment,whereasthatofP388D1cellsrequiredmorethan20min.TheotherpropertiesofLPS-responsiveenzymesstudiedweresimilarbetweentwocelllines,ineludingActivationofPLCandPLA2andPKCinmacrophagesbyLPSCa2+augmentationofenzymeactivation,participationofguaninenucleotidebinding（G）proteinsintheinitialactivationprocesses,andinhibitionofenzymeactivationbythepriortreatmentofcellswithcholeraorpartussistoxinsetc.Moreover,LPS-triggeredactivationofPLCandPLA2wasfoundtobefollowedbytheincreaseofPKCactivitiesinbothcelllines.Inspiteofthesesimilarities,J774cellspossessedbothbasicandacidicformsofPKCactivities,whileP388D1cellsownedonlyPKCofbasicform.Nevertheless,thequestionwhyJ774cells,butnotP388D1cells,canacquirethetumoricidalactiyity,aganistP815cellsfollowingLPS-treatmentremainstobeanswered.

简介：为了验证普通菜豆脯氨酸合成酶基因PvP5CS2在改善作物抗旱性方面的作用，构建了普通菜豆PvP5CS2基因的烟草表达载体pCAPE2-PvP5CS2，利用农杆菌将PvP5CS2导入烟草，获得15株阳性转PvP5CS2基因植株。干旱胁迫条件下，转基因烟草植株和野生型植株叶片中脯氨酸含量、叶片相对含水量和萎蔫叶片数的差异均达到极显著水平。转基因烟草的脯氨酸含量、叶片相对含水量分别是野生型的2．30倍和1．26倍，而萎蔫叶片数只相当于野生型的90％。表明超表达PvP5CS2基因的烟草植株在干旱胁迫条件下能积累较多的脯氨酸，抗旱性得到初步改善。