番荔枝花发育不同时期的数字基因表达谱分析

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摘要 采用IllunimaHiSeq^TM2500测序技术对不同发育时期的番荔枝花进行从头组装和注释分析,以期得到和挖掘更多与番荔枝花发育相关的基因数据和功能.测序结果表明:番荔枝花在不同发育时期中4个开花调控途径均已启动.转录组测序共获得107197488条cleanreads,包含13399686000个核苷酸序列信息.对原始数据进行组装,获得71948条Unigenes序列信息,平均长度为825.4bp,将获得的Unigene序列与已知数据库进行比对,共有24911条Unigene被注释到.其中,8682条Unigene被注释到COG,COG功能涉及到各种类的生命活动,整体功能类的基因最多,有2403条;6837条Unigene匹配到KEGG数据库,Unigene参与的番荔枝代谢通路可以分为124类.
机构地区 不详
出处 《岭南师范学院学报》 2018年3期
出版日期 2018年03月13日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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