摘要
摘要 目的：通过分析 GEO数据库中食管癌的芯片数据集，挖掘差异表达基因，并在 TCGA数据库中验证，寻找食管癌的候选肿瘤标志物。方法：分析 GEO数据库中食管癌的三个芯片数据集 GSE17351、 GSE75241、 GSE89102，分别搜索差异表达基因，利用韦恩软件寻找核心基因。在 TCGA数据库中验证核心基因，并且进行 GO功能注释和 KEGG代谢通路分析。最后对通过验证的核心基因进行生存分析。结果： GSE17351芯片数据集筛选出 618个差异表达基因，其中下调基因 265个，上调基因 353个； GSE75241芯片数据集筛选出 1652个差异表达基因，其中下调基因 481个，上调基因 1171个； GSE89102芯片数据集筛选出 7939个差异表达基因，其中下调基因 312个，上调基因 7627个。利用韦恩软件，发现核心基因 115个，上调基因 94个，下调基因 94个。在 TCGA数据库中进行了验证、 GO功能注释和 KEGG代谢通路分析。对通过验证的核心基因进行生存分析，发现 CDKN3、 NUP155、 RAD51AP1可以作为食管癌的候选肿瘤标志物。
出版日期
2020年01月13日（中国期刊网平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
