简介：摘要为探讨海南岛的小泡巨鼠肠道微生物群落组成及其菌群多样性。2019年12月于海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室提取25只海南岛的成年小泡巨鼠（14只雄和11只雌性）粪便样本DNA，基于IonS5TMXL测序平台，利用单端测序（Single-End）的方法，构建小片段文库进行单端测序。通过对测序片段剪切过滤，操作分类单元（Operational Taxonomic Units，OTUs）聚类，利用mothur方法与SSUrRNA数据库对OTUs进行物种注释及丰度分析，并进一步开展α多样性分析（Alpha Diversity）和β多样性分析（Beta Diversity）。结果显示，从25只小泡巨鼠肠道粪便样本中共得到高质量序列1481842条，归属为14个门、85个科、186个属。从门分类水平上，小泡巨鼠的主要核心生物群有厚壁菌门（Firmicutes，46.04%），拟杆菌门（Bacteroidetes，25.34%）；随后依次为变形菌门（Proteobacteria，17.09%），柔壁菌门（Tenericutes，7.38%），放线菌门（Actinobacteria，1.67%）；这5个门占所有菌门的97.52%。属水平上螺杆菌属（Helicobacter）所占比例最大，为12.44%；其次为乳杆菌属（Lactobacillus，11.39%），梭菌属（Clostridium，6.19%），支原体属（Mycoplasma，4.23%），黄杆菌属（Flavonifractor，3.52%）。综上，高通量测序分析表明海南岛小泡巨鼠肠道菌群结构复杂，菌种多样，具有进一步研究的意义。

简介：摘要为探讨糖尿病患者足趾感染的病因，采用微生物形态学结合分子生物学方法对2021年9月海南省人民医院的1例老年糖尿病患者足趾伤口分泌物培养分离出的白喉棒状杆菌溯源分析，为临床感染诊断提供参考。通过革兰染色、Albert法染色镜检、VITEK 2 Compat鉴定仪和MALDI-TOF MS质谱仪鉴定结合16S rRNA基因序列溯源分析，同时开展tox毒力基因检测。结果显示分离菌株镜检为革兰阳性杆菌，有异染颗粒，可发酵大多数糖类，符合白喉棒状杆菌生物学特性；16S rRNA序列与白喉棒状杆菌标准菌株Corynebacterium diphtheriae NCTC 11397T（GenBank登记号：MW682323.1）同源性为100%；tox毒力基因阴性。本研究结果为临床微生物实验室准确鉴定非产毒白喉棒状杆菌奠定了基础，同时为临床认识非产毒白喉棒状杆菌的感染风险提供依据。

简介：摘要分析比较临床1例重症肺炎患者痰标本培养出的平滑型脓肿分枝杆菌（MabS）和粗糙型脓肿分枝杆菌（MabR），并进行药敏试验研究，为临床诊断治疗提供科学依据。对MabS和MabR进行菌体形态观察、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）和16S rRNA基因序列测序比对，构建系统发育进化树进行同源性分析，并采用比例法和肉汤法进行体外药敏试验。MabS和MabR菌落形态不同，MALDI-TOF MS分析MabR有223个蛋白峰，MabS有147个蛋白峰。16s RNA基因测序MabS为1 397 bp，MabR为1 402 bp，药敏试验显示二者对抗结核药几乎耐药，对绝大部分抗菌药物敏感。MabS和MabR对抗结核治疗药物普遍耐药，而对抗菌药物几乎敏感，联合使用抗菌药物治疗有较好的疗效，可供临床参考。