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  • 简介:为了找出差异基因用于油酸油菜育种,对两个油酸含量不同油酸油菜材料(油酸含量分别为84.4%和56.2%)成熟种子进行转录组分析和实时荧光定量PCR分析。IlluminaHiseq,M2000测序得到8.09Gbcleanreads,组成52361个unigene,平均长度为659bp。比对公共数据库得到48911f93.41%)个氨基酸序列。鉴定出6414个在油酸油菜和低油酸油菜差异显著基因,这些基因有1296个在油酸油菜中上调表达(20.21%),5118个下调表达(79.79%),共有2043个差异基因在119个代谢通路中富集表达。将其中14个与脂肪酸代谢和光合作用相关基因进行荧光定量PCR验证。Bna0799930,Bna0104450和Bna0305890在油酸油菜中上调表达,其余下调表达。Bna0501620,Bna0391450和Bna0084310在油酸油菜表达量超过低油酸油菜中表达量2倍以上,分别为4.48倍,4.21倍和2.26倍。这些新发现差异基因可用于油酸油菜分子育种研究。

  • 标签: 高油酸油菜 转录组 定量PCR
  • 简介:本研究对甜瓜黄瓜基因启动子进行了元件分析。讨论以采集甜瓜叶片为试验材料,采用CTAB法提取植物DNA,并利用PCR扩增技术,成功获得了黄瓜启动子基因序列,利用DNAman、DNAstar等软件进行处理和分析序列结果,并采用PlantCARE和PLACE对启动子元件进行生物信息学元件分析。分析结果表明:黄瓜启动子与AY055805、LN713264、LN681897同源性为100%、99%、99%。其序列含有多种高等植物果实启动子通用顺式作用元件TATA-Box、CAAT-Box和光响应元件,同时部分序列还也参与了ABA、VP1反应和水杨酸反应。甜瓜黄瓜启动子研究为下步利用该启动子进行深入果实基因工程研究提供材料基础和理论依据。

  • 标签: 果实启动子 序列分析 黄瓜素基因 生物信息学分析 顺式作用元件
  • 简介:染色体重排和人类些遗传性疾病有很大关系,同时也是些动植物物种形成和分化重要原因。随着近年来在二代测序技术基础上比较基因组学发展,近缘物种间染色体重研究越来越受到关注。本评述总结了染色体重排产生方式,基本类型各自细胞学和遗传学效应,举例说明了染色体重排在物种分化和新物种形成作用并介绍了染色体重排事件研究方法和进展。通过这些信息,我们想为物种进化和分子标记辅助育种方面的研究人员提供参考和借鉴。

  • 标签: 染色体重排 物种分化 遗传学效应 细胞学效应
  • 简介:采用YC4和YC9组合群体,该组合在F4代通过分子测定基因型分别为Aabb、aaBb和AaBb杂合型。通过近红外检测技术检测,YC4组合中高油酸类型表型频率为NIR值低于80%占19.77%,高于80%占80.23%。YC9组合中高油酸类型表型频率为NIR值低于80%占28.35%,高于80%占71.65%。考种结果表明,筛选紫色种皮油酸花生且产量高于‘冀花5号’花生品种50%以上材料,YC4组合群体共筛选到材料69株,果类型50株,大果类型19株。果类型荚果形状多为普通型,果嘴形状多为中等或明显;大果类型荚果形状也多为普通型,果嘴形状多为中等或明显;YC9组合群体共筛选到19株材料,果类型13株,大果类型6株。果类型荚果形状多为普通型,果嘴形状多为中等或明显;大果类型荚果形状多为普通型或茧型,果嘴形状多为中等或非常明显。通过继代选择,获得3个紫色种皮油酸新品系ZG-4-19-5-3、ZG-4-20-18-1和ZG-9-15-9-5,油酸NIR值分别为86.92%、85.77%和88.14%,分子鉴定结果与其表型致。该批新种质材料创制不仅提高了油酸花生医疗保健价值,同时对中国油酸花生种质资源丰富品质育种具有重要意义。

  • 标签: 花生 紫色种皮 高油酸 荚果性状
  • 简介:为研究黄金茶出芽早分子机制,本研究采用SMART-RACE技术,获得了与解除休眠相关转录因子CsDAM2基因全长eDNA序列,并进步对该氨基酸序列进行了生物信息学分析。研究发现CsDAM2基因全长为1386bp,序列分析表明,该序列含有个完整编码区,大小为657bp,编码区GC含量为50.45%。此编码区可以编码分子量为24.86kD亲水性蛋白,该蛋白由218个氨基酸组成,理论等电点(pI)为8.96。黄金茶CsDAM2蛋白有11个磷酸化位点,属跨膜蛋白,与毛白杨DAM3相似性为71%,与已登录茶树MADS.box蛋白致性为35%。本研究为进步揭示黄金茶春芽萌发早分子机制提供了理论依据。

  • 标签: 黄金茶 CsDAM2基因 全长克隆 序列分析
  • 简介:鉴定合成或通过高通量随机组合方法获得潜在功能片段生物学功能需要套高效便捷酵母表达专用载体。酵母表达载体pYES2多克隆位点处不含起始密码子,通过设计含有ATG和EcoRⅠ酶切位点特异性引物扩增段Intron,利用In-Fusion重组技术(Clontech)将该片段构建至酵母表达载体pYES2,得到个含有ATG重组酵母表达载体pYES2-ATG。为了检测该载体功能,扩增不含起始密码子DNA序列nlea,该序列由本实验室设计合成,具有潜在耐盐功能。构建重组表达载体pYES2-ATG-nlea在酵母中进行功能鉴定。研究结果表明,半乳糖诱导后,含pYES2-ATG-nlea重组酵母菌株耐盐能力明显高于含pYES2-ATG空质粒菌株,表明在该载体系统上添加了起始密码子nlea成功表达,具有耐盐性,同时也证明改造载体系统可用于没有起始密码子编码区序列功能筛选和鉴定。pYES2-ATG酵母载体系统不影响原始载体基本功能元件表达,同时能使不含起始密码子编码区序列在酵母中正常表达,在大规模进行多个基因功能鉴定具有重要应用价值。

  • 标签: 起始密码子 酿酒酵母 pYES2 In-Fusion重组技术
  • 简介:高干率、高胡萝卜甘薯新品种福薯604是以广薯87为母本计划集团杂交选育而来,2016年通过国家甘薯新品种鉴定委员会鉴定,鉴定编号为国品鉴甘薯2016008。通过对福薯604形态特征、生产力、生长动态、品质特性抗病性等生理特点进行多年多点研究,结果表明:福薯604鲜薯产量和薯干产量分别比对照广薯87分别增产17.15%和21.69%,薯块干物质含量达到30.43%,食味、外观品质优,同时富含多种营养物质,其中胡萝卜含量达到7.6mg/100g,抗蔓割病和I型薯瘟病,适于在中国南方甘薯种植区域种植。

  • 标签: 甘薯 高淀粉 高胡萝卜素 福薯604
  • 简介:本研究以6个超级稻品种(组合)1个耐旱常规稻品种为材料,在防雨棚内进行盆栽试验,研究了孕穗干旱胁迫对超级稻剑叶部分生理指标产量影响。结果表明:孕穗干旱胁迫处理使超级稻剑叶含糖量、脯氨酸丙二醛含量均有显著或极显著增加,过氧化物酶、超氧化物歧化酶活性均极显著提高;有效穗穗实粒数下降,千粒重提高;生物产量经济产量均有不同程度下降;Y两优2号、新两优6号、丰两优4号在正常灌溉干旱处理条件下经济产量均位居前三位,且较其他品种产量提高均达极显著水平。建议,在安徽江淮丘陵区可以推广种植Y两优2号、新两优6号、丰两优4号。

  • 标签: 水稻 孕穗期 干旱胁迫 生理指标 产量
  • 简介:本研究以普通小麦品种‘中国春’染色体组DNA为封阻,用生物(biotin-16-dUTP)标记大麦染色体组DNA作为探针,通过基因组原位杂交法解析了来自杂交组合CS×(CS+Betzes2H)杂种后代X99-13遗传组成,此材料含有42条染色体,其中1条大麦染色体,2条小麦-大麦易位染色体和39条小麦染色体,鉴定为小麦-大麦代换易位系。以小麦第二部分同源群短臂探针psr131进行RFLP分析,结果表明此代换易位系是涉及小麦染色体2B和大麦染色体2H代换易位。为进步选育小麦-大麦2H纯合易位系利用其上α-淀粉酶抑制蛋白基因打下了坚实物质基础。

  • 标签: 小麦 大麦 代换易位系 GISH RFLP
  • 简介:干旱应答元件结合蛋白(dehydrationresponsiveelementbindingprotein,DREB),在植物应对干旱、盐碱和低温胁迫反应起非常重要调控作用。利用已知甘蔗栽培种DREB2转录因子序列,设计引物,按照同源克隆方法,获得了2个割手密DREB2基因组DNA序列,分别命名为SsDREB2-a和SsDREB2-f(GenBank登录号分别为:KU963272和KU963277)。序列分析结果表明,SsDREB2-a基因序列全长为1578bp,SsDREB2-f基因序列全长为1729bp,2个基因均包含1个内含子和2个外显子。SsDREB2-a和SsDREB2-f基因cDNA序列全长分别为824bp和971bp,均编码262个氨基酸。序列比对分析显示,2个基因序列相似性为96.6%,编码蛋白相似性为98.9%,存在3个氨基酸变异位点。系统进化分析结果显示,割手密DREB2转录因子与高粱、牛鞭草、斑茅、玉米等植物DREB2转录因子同源关系最近。基因获得为下步了解DREB2基因表达与割手密抵御非生物胁迫能力之间关系奠定了基础。

  • 标签: 割手密 DREB2 基因克隆 比较分析
  • 简介:以黑果枸杞为研究对象,利用RT-PCR方法从黑果枸杞cDNA克隆个bHLH转录因子-LrJAF13,通过生物信息学分析,发现该基因全长为1890bp,编码624个氨基酸亲水蛋白,其分子式是C3O12H4843N853O978S24,分子量为6.94kD,脂肪指数(Aliphaticindex)为85.45,等电点pI为5.24,亲水性(Grandaverageofhydropathicity)为-0.497,不稳定指数(Instabilityindex)为50.13,推断出该基因编码蛋白位于细胞核,蛋白质三维结构复杂,包含多个α-螺旋和β-折叠结构,与矮牵牛拟南芥bHLH基因编码蛋白序列致性为88%,进化树分析表明黑果枸杞LrJAF13与矮牵牛bHLH转录因子petunia_JAFl3亲缘关系比较接近。通过上述分析,为解析黑果枸杞果实中高花青含量分子遗传机理、优异资源筛选和新品种选育提供了理论依据。

  • 标签: 黑果枸杞 BHLH 基因克隆 序列分析
  • 简介:巨胚米富含γ-氨基丁酸(gamma-aminobutyricacid,GABA)具有缓解和预防血压上升功效。本研究对江苏地方巨胚种质10217巨胚基因进行了克隆,发现其GE基因编码区有三个位点发生突变,第1090个碱基由C突变为G;第1302个碱基由T突变为G;第1467个碱基由G突变为A,提前形成个终止密码子TGA。10217ge基因是个新ge等位基因。本研究根据ge基因突变位点设计了对共显性CAPS标记GE-2,对10217/日本晴F2分离群体进行分析后,证实GE基因突变导致了10217巨胚表型。本研究开发GE-2标记区分GEGE、GEge和gege三种基因型,可直接用于ge基因分子标记辅助选择育种和基因聚合育种。

  • 标签: 水稻 巨胚基因 分子标记
  • 简介:农杆菌介导遗传转化生物技术已经被广泛应用。蚜传辅助因子(helpercomponent-proteinase,HC-Pro)是种RNA沉默抑制子,而HC-Pro蛋白对植物基因组DNA甲基化影响及其作用机制并不十分清楚。我们采用农杆菌介导烟草(NicotianabenthamianaL.)叶盘转化法将外源基因HC-Pro转化烟草。并优化了各种侵染条件,包括农杆菌重悬液浓度,选择培养基卡那霉素浓度和生根培养基活性炭比例。此外,我们介绍了种简单而有效生根技术,即水培生根法,并利用这种技术快速获得了HC-Pro转基因株系。半定量RT-PCR(Reversetranscription-PCR)检测结果表明,HC-Pro在转基因烟草转基因后代植株稳定表达,为HC-Pro蛋白功能研究提供了实验帮助。

  • 标签: 烟草 叶盘转化法 RNA沉默抑制子 蚜传辅助因子
  • 简介:本研究建立了以甘蓝型油菜下胚轴为外植体步不定芽再生培养和遗传转化体系。首先,以甘蓝型油菜双11号含部分子叶节下胚轴为外植体,从6-BA和NAA配比、AgNO3以及无菌苗苗龄等方面对影响油菜组织培养因素进行了研究,建立了甘蓝型油菜快速高频步不定芽再生培养技术体系。该技术体系为,切取5d苗龄含部分子叶节下胚轴置于添加4mg/L6-BAMS基本培养基培养,5d再生出不定芽,再生频率为100%。在此基础上,进行了甘蓝型油菜遗传转化,成功地将用pFGC5941双元载体构建BnTFL1基因干扰载体转入双11号。整个转化过程,芽诱导生成只需5d,接着完成抗性芽PPT筛选需要30d,整个转化周期从播种到得到生根抗性苗仅需大约70d,而传统转化方法抗性芽诱导筛选需要90d,整个转化周期需要130d左右,大大缩短了转化周期,简化了转化过程,提高了转化效率。

  • 标签: 油菜 下胚轴 子叶节 一步再生培养 遗传转化
  • 简介:荧光原位杂交技术(fluorescenceinsituhybridization,FISH)在植物研究已被广泛应用,它是20世纪80年代发展起来种非放射性原位杂交技术,是将特定DNA序列定位在染色体或染色质上门新兴分子细胞遗传学方法。该技术灵敏度和准确性较高并且安全、直观。本文简单介绍了该技术基本原理,重点从染色体制片、探针标记技术、染色质凝缩程度、与分带技术相结合和单拷贝或低拷贝基因检测等方面,阐述了近些年该技术发展状况,最后本文概述了该技术在基因工程育种应用,并展望其应用前景。

  • 标签: 荧光原位杂交 染色体 基因工程
  • 简介:种子萌发,筛选、鉴定高粱抗旱材料对挖掘种子萌发抗旱基因以及培育抗旱性更强高粱品种都具有重要意义。本研究采用聚乙二醇(PEG6000)模拟干旱胁迫,设置0(CK)、5%、10%、15%、17.5%、20%、22.5%和25%8个不同浓度梯度PEG6000对粒用高粱BTx623和甜高粱Rio进行干旱处理,确定PEG6000初步筛选浓度,然后利用PEG6000初步筛选浓度对全球收集396份高粱进行初步筛选,筛选出较抗旱材料逐渐加大选择压力,最终筛选出高抗旱性高粱材料。基于以上试验,确定了大批材料初步筛选时PEG6000浓度为15%较为适宜。396份高粱材料经过15%PEG6000初步筛选时,相对出苗率达到80%以上有89份,逐步加大筛选压力,最终筛选出4份抗旱能力很强高粱材料,其中3份来自中国粒用高粱,1份来自东亚粒用高粱。随着处理浓度增加,高粱抗旱性和耐盐性两者之间相关性存在不确定性。

  • 标签: 高粱 种子萌发期 干旱胁迫 相对出苗率
  • 简介:通过正交试验建立芦笋ISSR优化反应体系,并对其反应程序进行优化。实验结果表明,优化扩增体系:25μL反应体系含150ng模板DNA、0.3μmol/L引物、15μL2×Mastermix;优化反应程序:94℃预变性5min;94℃变性45s,设定温度退火60s,72℃延伸45s,循环30;然后72℃延伸10min,4℃保存;筛选到了21条引物并确定其最优退火温度。实验结果为芦笋资源遗传多样性评价研究奠定基础。

  • 标签: 芦笋 ISSR 体系优化
  • 简介:DREB类转录因子是类植物特有的,在非生物逆境胁迫起重要作用调控因子。本研究以割手密为材料,采用同源基因克隆方法克隆获得2个DREB2类转录因子基因SsDREB2-1和SsDREB2-2(GenBank登录号分别为KU963264和KU963265)。序列分析表明,这2个基因长度分别为814bp和709bp,分别编码262和227个氨基酸;预测其蛋白质分子量分别为28.66kD和24.95kD,等电点(PI)分别为5.42和6.47。氨基酸亲水/疏水性分析表明,这2个转录因子属于亲水性蛋白。多序列比对分析表明,两基因序列相似性为98.7%。原核表达分析表明,这2个基因编码区正常表达出目的蛋白,说明得到2个基因为功能基因而非假基因。

  • 标签: 割手密 DREB 基因克隆 原核表达
  • 简介:UXS基因参与植物细胞壁合成过程,在植物生长发育起着重要作用。本研究采用生物信息学方法鉴定了玉米全基因组全部UXS结构基因,对其命名和检测相关属性,并对玉米UXS结构基因家族进行构建进化树和染色体定位。通过对进化树分析可清晰地看出基因相似程度和基因之间亲缘进化关系,染色体定位图分析可看出基因在染色体上位置,为进步了解UXS结构域基因家族在玉米植株作用功能分析提供了重要依据。

  • 标签: 玉米 UXS基因 木糖 生物信息学 进化树
  • 简介:硒不但是人类和动物必需微量元素,其在植物生长发育过程也起着重要作用。已有研究表明,适当硒处理可以提高植物产量和品质,增强植物抗逆性,但是过高硒会损害植物结构,抑制生长,降低叶绿素含量。但对于硒对植物叶绿体光合作用影响尚未进行过系统总结。本研究通过分析和总结硒是如何通过对叶绿体光合作用实施调控,进而改变作物品质植物抗逆性,为合理、安全施用硒肥提供理论依据,使之可以更好地发挥有益于农业生产和人类健康生物学效应。

  • 标签: 植物 叶绿体 光合作用 抗逆性