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51 个结果
  • 简介:Circulargenomes,beingthelargestproportionofsequencedgenomes,playanimportantroleingenomeanalysis.However,traditional2Dcircularmaponlyprovidesanoverviewandannotationsofgenomebutdoesnotofferfeature-basedcomparison.Forremedyingtheseshortcomings,wedeveloped3DGenomeTuner,ahybridofcircularmapandcomparativemaptools.Itscapabilityofviewingcomparisonsbetweenmultiplecircularmapsina3Dspaceoffersgreatbenefitstothestudyofcomparativegenomics.Theprogramisfreelyavailable(underanLGPLlicence)athttp://sourceforge.net/projects/dgenometuner.

  • 标签: 基因组分析 三维空间 调谐器 多循环 语境 比较基因组学
  • 简介:据国外媒体1月29日报道。最新研究显示,维生素D或能缓解哮喘症状,体内维生素D含量不足的患者,哮喘症状更严重。

  • 标签: 维生素D 症状 哮喘
  • 简介:C3d是补体C3不可再被酶解的最小片段,在抗原特异性免疫建立之前,C3d可识别非己抗原并与之共价结合,增强了抗原递呈细胞的递呈能力、降低了B细胞的活化阈、提高特异性抗体的滴度、促进抗体亲和力成熟等.近年来研究显示,C3d还可以促进抗原特异性细胞免疫应答水平并改变机体免疫应答模式.所以,C3d是连接固有性免疫和获得性免疫的桥梁.本文对C3d的分子生物学特征、生物学功能以及作为分子佐剂可能的分子机制进行了简要总结.

  • 标签: C3D 免疫应答 分子机制
  • 简介:【目的】水稻白叶枯病是一种严重危害水稻的细菌性病害,培育抗性品种是治理该病害的重要途径。因此,明确云南水稻材料对检疫性病害水稻白叶枯病的抗性,可以为该病害的防治与监测、水稻栽培的合理布局和良好抗性资源的获取提供依据。【方法】采用剪叶接种法测定云南稻区30个品种对7个不同致病型白叶枯病菌的抗性。【结果】在供试的30个云南水稻品种中,2个品种(玉粳16和JS42糯稻)对7个不同致病型菌株均表现为抗性;15个品种对7个致病型菌株均表现感病;对HEN11、SCYC-6、YN7、YN11、FUJ、YN241和PX099等7个致病型菌株表现抗性的水稻品种分别占26.67%、16.67%、23.33%、13.33%、6.67%、10.00%和20.00%。此外,区试材料的抗性比例高于主栽品种,地方稻未发现抗性品种。【结论】现在生产上的大部分水稻品种对优势致病型病原菌入侵的抵抗能力降低甚至丧失。针对云南地区的优势致病小种FUJ筛选得到2个抗性品种:玉粳16和JS42糯稻。

  • 标签: 水稻种质 云南 水稻白叶枯病 抗性评价
  • 简介:Ithasbeenshownthattheprogressinthedeterminationofmembraneproteinstructuregrowsexponentially,withapproximatelythesamegrowthrateasthatofthewater-solubleproteins.Inordertoinvestigatetheeffectofthis,ontheperformanceofpredictionalgorithmsforbothα-helicalandβ-barrelmembraneproteins,weconductedaprospectivestudybasedonhistoricalrecords.WetrainedseparatehiddenMarkovmodelswithdifferentsizedtrainingsetsandevaluatedtheirperformanceontopologypredictionforthetwoclassesoftransmembraneproteins.Weshowthattheexistingtop-scoringalgorithmsforpredictingthetransmembranesegmentsofα-helicalmembraneproteinsperformslightlybetterthanthatofβ-barreloutermembraneproteinsinallmeasuresofaccuracy.Withthesamerationale,ameta-analysisoftheperformanceofthesecondarystructurepredictionalgorithmsindicatesthatexistingalgorithmictechniquescannotbefurtherimprovedbyjustaddingmorenon-homologoussequencestothetrainingsets.Theupperlimitforsecondarystructurepredictionisestimatedtobenomorethan70%and80%ofcorrectlypredictedresiduesforsinglesequencebasedmethodsandmultiplesequencebasedones,respectively.Therefore,weshouldconcentrateoureffortsonutilizingnewtechniquesforthedevelopmentofevenbetterscoringpredictors.

  • 标签: 预测算法 三维结构 二级结构预测 跨膜蛋白质 隐马尔可夫模型 培养
  • 简介:在植物昆虫相互作用的偏爱表演关系是在进化生态学的一个中央主题。在许多昆虫之中,鸡蛋是脆弱的,幼虫限制了活动性,使一个适当oviposition地点的选择成为为女性的最重要的决定之一。我们由人工地为2个自然资源,葡萄和植物的一种为偏爱选择在果蝇melanogasterMeigen和果蝇simulansSturtevant调查了oviposition偏爱的进化。我们的学习的主要发现是D的微分回答。melanogaster和D。simulans。尽管偏爱在D的试验性的人口演变。melanogaster,回答不与政体使用了的选择一致。相反,在D的回答。simulans与期望一致,证明这种有为特点的可选的基因变化。而且,在D之间交叉。simulans分叉的线证明涉及葡萄偏爱的基因因素看起来大部分后退。在摘要,我们的人工的选择学习建议那D。melanogaster和D。simulans为这个特点拥有不同基因体系结构。

  • 标签: 黑腹果蝇 人工选择 微分响应 偏好 产卵 进化生态学
  • 简介:以便获得米饭幼仔圆锥花序proteome的高分辨的electrophorogram,我们评估了通常使用在的各种各样的协议二维(2D)蛋白质的polyacrylamide胶化电气泳动(页)包括染色协议的胶化,使不能调动的pH坡度(IPG)的pH范围脱衣并且样品装载数量。结果证明染色协议使用的银敏化包含冰川的醋酸,钠醋酸盐和钠thiosulfate的答案(在1988由Heukeshoven和Dernick报导了)并且染色方法使用答案包含的Coomassie灿烂的蓝色G-250,铵硫酸盐和磷的酸(在2010由粉红色的等报导了)表明了优异染色效果。另外,当有5-8的pH范围的IPG胶化长带被使用时,我们也与4-7的pH范围证明更高的分辨被完成,与那相比。最后,最佳的装载数量作为与染色协议的银硝酸盐在联合与pH5-8使用17厘米长的非线性的IPG长带的130g被决定。评估结果将在年轻米饭颖果的proteome分析是有用的。

  • 标签: 聚丙烯酰胺凝胶电泳 蛋白质组分 协议 水稻 评价 颖果
  • 简介:CellsregulatephospholipaseD(PLD)activityinresponsetonumerousextracellularsignals.Here,weinvestigatedtheinvolvementofPLDactivityintransforminggrowthfactor-β(TGF-β1)-mediatedgrowthinhibitionofepithelialcells.TGF-β1)-mediatedgrowthinhibitionofepithelialcells.TGF-β1inhibitsthegrowthofMDCK,Mv1Lu,andA-549cells.Inthepresenceof0.4%butanol,TGF-β1inducesanincreaseintheformationofphosphatidylbutanol,auniqueproductcatalyzedbyPLD.TGF-β1alsoinducesanincreaseinphosphatidicacid(PA)levelinA-549andMDCKcells.TGF-β1inducesanincreaseinthelevelsofDAGlabeledwith[^3H]-myristicacidinA-549andMDCKcellsbutnotinMv1Lucells.NoincreaseofDAGwasobservedincellsprelabeledwith[^3H]-arachidonicacid.ThedatapresentedsuggestthatPLDactivationisinvolvedintheTGF-β1-inducedcellgrowthinhibition.

  • 标签: 转化生长因子-Β 诱导 细胞生长抑制 磷酯酸D活性 激活 TGFΒ-1
  • 简介:本文通过室内模拟低温,研究了阿里山潜蝇茧蜂雌成蜂、9日龄蛹的致死中温度和线性拟合。结果表明,在不同温度下雌蜂的砜分别为4℃下6.6149天,7℃下8.1235天,100℃下9.6161天,13℃下5.0257天,且在所有温度下都有死亡陡升过程。9日龄蛹在不同温度下的LT50分别为4℃下8.4172天,7℃下8.1235天,10℃下13.9949天,13℃下18.4107天;同一温度下的蛹羽化与保存天数的关系适宜用二次方程拟合。研究认为蛹的耐寒性强于雌成蜂,可以作为低温保存的虫态。

  • 标签: 阿里山潜蝇茧蜂 低温储存 羽化率 死亡率 线性拟合
  • 简介:目的检测30周糖尿病大鼠胃排空情况幽门螺杆菌的感染状况.方法应用链脲佐菌素(Streptozotocin,STZ)建立30周糖尿病大鼠模型,然后采用酚红实验方法观察胃排空与胃幽门螺杆菌感染状况.结果30周糖尿病大鼠存在胃排空异常,中药"糖胃康"组与模型组比较有所改善,而幽门螺杆菌试纸检测呈阴性.结论30周糖尿病大鼠存在胃排空异常现象,不存在幽门螺杆菌感染.

  • 标签: 糖尿病 大鼠 胃排空 幽门螺杆菌
  • 简介:水稻在抽穗开花期对高温胁迫非常敏感,通过挖掘耐热资源,培育耐热水稻品种是应对高温热害最有效的方式。前期研究发现,地方稻资源D43在花期连续高温条件下能保持较高的结实。本研究在大田和人工气候室不同高温处理下,分析了D43的开花时间与耐热性之间的相互关系。结果表明,高温能够使水稻的开花时间提前,D43表现出稳定的早花时特性,高温胁迫下的开花时间集中在8∶30~10∶00;在开花时间段恒定高温胁迫下,D43的结实较低;但在大田高温和人工气候室模拟高温胁迫下,D43的开花时间避开了日高温段,从而表现出较高的结实;花器官形态性状包括花药开裂、柱头上的花粉附着数、花粉萌发数与结实之间呈显著正相关,因此可用于评价水稻的花期耐热性。

  • 标签: 水稻 耐热性 开花时间
  • 简介:对消费者而言,烟支点燃端烟丝的掉落会直接导致抽吸口数的减少,而端部落丝量是衡量卷烟在生产制造过程、销售运输期间烟丝掉落量的检测指标。因此,端部落丝量超标是直接涉及到消费者的利益的重要问题。

  • 标签: 烟丝含水率 烟梗润透率 端部落丝量
  • 简介:目的:研究同侧俯卧位对枕后位产程活跃期停滞胎方位纠正和自然分娩的影响。方法:选取我院收治的枕后位产程活跃期停滞产妇160例,采取数字随机法分成同侧组自由组,同侧组采取同侧俯卧位治疗,自由组采取自由卧位治疗,比较两组的治疗对产妇的胎方位纠正及自然分娩的影响。结果:同侧组胎方位纠正90.00%,自由组胎方位纠正31.25%,同侧组胎方位纠正高于自由组,差异有统计学意义(P〈0.05)。同侧组自然分娩91.25%,自由组自然分娩77.50%,同侧组自然分娩高于自由组,差异有统计学意义(P〈0.05)。结论:同侧俯卧位可提高枕后位产程活跃期停滞胎方位纠正和自然分娩,并且无创简便,是一种有效的干预方法。

  • 标签: 同侧俯卧位 枕后位 产程活跃期停滞 胎方位纠正率 自然分娩率
  • 简介:兼容丑恶纸巾的表面上的花粉萌芽是为植物授精的必要的步。这里,我们报导Arabidopsis变异的bcl1是由于花粉萌芽的失败不育的男性。我们证明bcl1异种等位基因不能被男配偶体播送,没有同型结合的bcl1异种被获得。花粉发育阶段的分析显示bcl1变化影响花粉萌芽然而并非花粉成熟。分子的分析证明花粉萌芽的失败被AtBECLIN1的混乱引起。AtBECLIN1在成熟花粉主要被表示并且与重要相同编码蛋白质到在酵母为autophagyandvacuolar蛋白质排序的过程(VPS)要求的Beclin1/Atg6/Vps30。我们也证明AtBECLIN1为正常被要求植物开发,和那与autophagy,VPS和glycosylphosphatidylinositolanchor系统有关的基因,被AtBECLIN1的缺乏影响。

  • 标签: 拟南芥 AtBECLIN1 花粉萌发 植物发育
  • 简介:目的探讨血浆(1—3)-β-D-葡聚糖对早期诊断深部真菌感染的临床价值。方法收集2009年3月-11月间在北京友谊医院感染科住院患者174例,根据侵袭性真菌感染诊断标准,将患者分为排除深部真菌组、确诊组、临床诊断组、拟诊组。应用MB-80微生物动态快速检测系统,检测各组患者血浆(1—3)-β—D-葡聚糖水平,分析比较深部真菌感染组和非深部真菌感染组血浆(1-3)-β-D-葡聚糖的水平。结果深部真菌感染组血清(1-3)-β-D-葡聚糖含量为(153.4±37.0)pg/mL,排除深部真菌感染组血清(1-3)-β—D-葡聚糖含量为(54.6±8.6)pg/mL,两组间有统计学差异(t=3.4,P〈0.01);分析血浆(1-3)-β-D-葡聚糖诊断深部真菌感染,以20pg/mL为诊断阈值,其准确、敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别为70.1%、87.5%、61.9%、52.1%、91.2%。确诊病例、临床诊断病例、拟诊病例,3组间血清(1—3)-β-D-葡聚糖含量无统计学差异(P〉0.05)。结论深部真菌感染组的葡聚糖水平明显高于排除深部真菌感染组的葡聚糖水平,具有统计学意义。以20pg/mL为诊断阈值,其准确、敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别为70.1%、87.5%、61.9%、52.1%、91.2%,可作为深部真菌感染的最佳诊断阈值。

  • 标签: 血浆(1—3)-β—D-葡聚糖 深部真菌感染 诊断研究
  • 简介:CCAAT/enhancer有约束力的蛋白质α(C/EBPα)是transcriptional禁止细胞增殖的规章的因素,和其他的翻译开始生产二多肽,C/EBPαp30并且C/EBPαp42。由表示介绍,C/EBPαp30specifically禁止了基因的一个唯一的集合,这被揭示,包括MPP11,p84N5和SMYD2,它没被C/EBPαp影响42在两根QSG-7701hepatocyte房间线和QGY-7703hepatoma,cells.Semi量的RT-PCR分析独立地证实了这些结果。Chromatinimmunoprecipitation试金显示出30比C/EBPαp更强烈绑了在这些基因的倡导者的那C/EBPαp42。在C/EBPα是调整的down的临床的hepatoma在样品,所有三基因明确地由30在上面的C/EBPαp禁止了调整。然而,MPP11,p84N5和SMYD2genes的压抑可能直接不涉及C/EBPαp30-mediated生长抑制。我们的数据建议30调整的那C/EBPαp目标基因的一个唯一的集合并且多于C/EBPαp的dominant-negativeregulator42。

  • 标签: CCAAT增强子结合蛋白 C/EBPαp30 C/EBPαp42 转录调节作用 表达模式
  • 简介:目的揭示宿主磷脂酶D(phospholipaseD,PLD)应对烟曲霉感染过程中的重要作用和可能机制。方法应用滴鼻方式使野生小鼠和磷脂酶D双基因敲除小鼠(pld1^-/-pld2^-/-)感染烟曲霉孢子后,取小鼠肺组织、抽取支气管肺泡灌洗液,应用组织匀桨与菌落计数的方法检测小鼠肺组织中烟曲霉负荷,采用eBioscience公司的多因子检测试剂盒检测肺泡灌洗液中炎症因子分泌情况;分离两种小鼠的骨髓细胞并诱导分化为成熟巨噬细胞(BMDM),制霉菌素法检测其吞噬和杀死烟曲霉孢子的能力。结果感染烟曲霉孢子6h后,pld1^-/-pld2^-/-小鼠肺部真菌负荷显著高于野生小鼠,其肺泡灌洗液和肺泡巨噬细胞中均存在大量孢子,肺泡灌洗液中炎症因子浓度显著升高;体外实验证明pld1^-/-pld2^-/-小鼠的BMDM细胞吞噬和杀死烟曲霉孢子的能力显著减弱。结论小鼠pld1基因和pld2基因同时敲除导致其巨噬细胞的吞噬和杀死烟曲霉孢子的能力显著减弱,进而可能降低小鼠抗烟曲霉感染的能力。同时机体可能通过分泌大量的炎症因子以招募其他免疫细胞杀灭烟曲霉孢子。

  • 标签: 磷脂酶D 烟曲霉感染 巨噬细胞 炎症因子