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  • 简介:摘要采用PCR-DGGE技术对中华按蚊成虫肠道细菌多样性进行研究,共检测到12条16SrRNA基因序列。在系统发育地位上主要归入3个细菌纲丙型变形菌纲、黄杆菌纲和放线菌纲,其中有59.8%的细菌属于丙型变形菌纲,占绝对优势,成为中肠主要细菌群落。从而显示出中华按蚊成虫肠道细菌的复杂性和多样性

  • 标签: 中华按蚊,PCR-DGGE,肠道菌群,多样性
  • 简介:摘要PCR-DGGE技术目前已被广泛应用于环境微生物领域。介绍了PCR-DGGE技术的原理及其优点,概述了PCR-DGGE技术在环境工程废水微生物处理中的应用,分析了PCR-DGGE技术用于生物处理系统中微生物群落多样性和动态性研究的现状,并展望了其应用前景。

  • 标签: PCR-DGGE技术 微生物 应用
  • 作者: 焦晨
  • 学科: 经济管理 > 企业管理
  • 创建时间:2014-07-17
  • 出处:《价值工程》 2014年第7期
  • 机构:ApplicationofPCR-DGGEMethodintheStudyofMicrobialDiversityinWater焦晨淤JIAOChen曰夏甜于XIATian(淤内蒙古化工职业学院材料工程系,呼和浩特010070;于内蒙古化工职业学院思政理论教研部,呼和浩特010070)(淤DepartmentofMaterialsEngineering,InnerMongoliaVocationalCollegeofChemicalEngineering,Hohhot010070,China;于IdeologicalandPoliticalTheoryTeachingandResearchDepartment,InnerMongoliaVocationalCollegeofChemicalEngineering,Hohhot010070,China)
  • 简介:Soilmicrobialbiomassandcommunitystructuresarecommonlyusedasindicatorsforsoilqualityandfertility.Ainvestigationwasperformedtostudytheeffectsoflong-termnaturalrestoration,cropping,andbarefallowmanagementsonthesoilmicrobialbiomassandbacterialcommunitystructuresindepthsof0–10,20–30,and40–50cminablacksoil(Mollisol).Microbialbiomasswasestimatedfromchloroformfumigation-extraction,andbacterialcommunitystructuresweredeterminedbyanalysisof16SrDNAusingpolymerasechainreaction-denaturinggradientgelelectrophoresis(PCR-DGGE).Experimentalresultsshowedthatmicrobialbiomasssignificantlydeclinedwithsoildepthinthemanagementsofrestorationandcropping,butnotinthebarefallow.DGGEprofilesindicatedthatthebandnumberintop0–10cmsoilswaslessthanthatindepthof20–30or40–50cm.Thesesuggestedthatthemicrobialpopulationwashighbutthebacterialcommunitystructurewassimpleinthetopsoil.ClusterandprinciplecomponentanalysisbasedonDGGEbandingpatternsshowedthatthebacterialcommunitystructurewasa?ectedbysoildepthmoreprimarilythanbymanagements,andthesuccessionofbacterialcommunityasincreaseofsoildepthhasasimilartendencyinthethreemanagements.FourteenpredominatingDGGEbandswereexcisedandsequenced,inwhich6bandswereidentifiedasthetaxaofVerrucomicrobia,2bandsasActinobacteria,2bandsasα-Proteobacteria,andtheother4bandsasδ-Proteobacteria,Acidobacteria,Nitrospira,andunclassifiedbacteria.Inaddition,thesequencesof11DGGEbandswerecloselyrelatedtounculturedbacteria.Thus,thebacterialcommunitystructureinblacksoilwasstable,andthepredominatingbacterialgroupswereuncultured.

  • 标签: 细菌群体 群落结构 DGGE PCR 自然修复 种植
  • 简介:目的探讨溃疡性结肠炎对大鼠胃肠道微生物多样性影响,为治疗溃疡性结肠炎提供可靠依据。方法采用2,4-二硝基氯苯乙酸复合法对健康SD大鼠进行溃疡性结肠炎造模;运用CTAB—SDS法提取肠道微生物总DNA,通过PCRDGGE分析溃疡性结肠炎大鼠之间胃肠道微生物多样性差异。结果溃疡组、用药组和正常组大鼠的消化道中,不同部位细菌Shannon~数变化较大(1.64-3.05),结肠中Shannon指数最高,其次是胃,小肠最低。在结肠,不同组的细菌多样性Shannon指数变化幅度不大,以用药组最高(3.05),其次溃疡组(2.98),正常组2.95,说明大鼠结肠在健康状态下细菌多样性最低,结肠炎后会发生一定的变化。此外,发现病变后的大鼠胃中拟杆菌属、梭菌属、普氏菌属、紫单胞菌属等厌氧细菌增加,病变后的结肠中乳杆菌属细菌明显减少,紫单胞菌属和梭菌属细菌明显增加;病变后小肠中部分乳杆菌种类消失,同时梭菌属和紫单胞菌属等不常见菌群的出现。结论溃疡性结肠炎大鼠胃、小肠、结肠中有益菌乳杆菌明显减少,普氏菌属、紫单胞菌属、梭菌属等明显增多,这些菌属可作为条件致病菌引起内源性感染,可能是造成溃疡性结肠炎的重要原因。

  • 标签: 溃疡性结肠炎 微生物多样性 聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE) 2 4-二硝基氯苯乙酸复合法
  • 作者: 焦晨夏甜
  • 学科: 经济管理 > 企业管理
  • 创建时间:2014-09-19
  • 出处:《价值工程》 2014年第9期
  • 机构:焦晨淤JIAOChen曰夏甜于XIATian(淤内蒙古化工职业学院材料工程系,呼和浩特010070;于内蒙古化工职业学院思政理论教研部,呼和浩特010070)(淤DepartmentofMaterialsEngineering,InnerMongoliaVocationalCollegeofChemicalEngineering,Hohhot010070,China;于IdeologicalandPoliticalTheoryTeachingandResearchDepartment,InnerMongoliaVocationalCollegeofChemicalEngineering,Hohhot010070,China)
  • 简介:PCR-DGGE技术已经发展成为研究微生物的群落结构和遗传多样性的有效工具。在世界水产养殖业的养殖系统微生态学、肠道细菌微生态学和益生菌研究中都取得了一系列的应用成果,而在我国冷水鱼的研究中应用还较少。本文介绍了PCR-DGGE技术的特性及其在世界水产养殖业研究中的应用,分析了其在我国冷水鱼微生态学研究中的应用前景。

  • 标签: 变性梯度凝胶电泳 冷水鱼微生态学 应用前景
  • 简介:目的:应用PCR-变性梯度凝胶电泳技术(denaturinggradientgelelectrophoresis,DGGE)技术检测早期儿童龋治疗前后唾液中微生物多样性的变化。方法:选取北京大学燕东幼儿园22名3-5岁儿童进行口腔检查,在龋齿治疗前和治疗后2周分别取样,采用PCR-DGGE技术检测受试儿童唾液样本,分析治疗前后唾液微生物多样性的变化。结果:治疗前唾液样本DGGE条带数为23±2.9,治疗后唾液样本DGGE条带数为28±4.1,差异有显著性(P〈0.01);在同一时期内各唾液样本DGGE图谱的相似性高于不同时期样本之间。结论:PCRDGGE技术可用于与龋病相关细菌的生物多样性的研究以及监测微生物群落组成的动态变化。

  • 标签: 早期儿童龋 变性梯度凝胶电泳 菌群多样性
  • 简介:目的胸苷酸合成酶(TS)是DNA合成的关键酶,在DNA合成与修复中起重要作用,是叶酸代谢循环中起中心作用的酶类之一,也是以5-氟尿嘧啶(5-FU)为基础化疗的靶酶,TS的遗传多态性在抗白血病等肿瘤疾病5-FU类药物的体内代谢中起着重要作用。该文研究胸苷酸合成酶基因编码区单核苷酸多态性(cSNP)及基因突变在急性白血病(AL)患儿和正常儿童中的分布情况,以探讨TS基因变异与AL患儿5-FU类药物化疗效应之间可能的相关性。方法应用RT—PCR一变性梯度凝胶电泳(RT—PCRDGGE)结合DNA直接测序技术,对53例AL患儿和115例正常儿童的cDNAs进行了TS基因cSNP及基因突变的筛查与鉴定,分析各基因型在两组之间的分布差异。结果首次鉴定了儿童TS381A〉G(E127E)cSNP位点,其在AL患儿及正常儿童中的等位基因频率分别为12.3%,13.5%,与国际SNP文库中12.3%基本一致。该cSNP在两组人群的等位基因频率差异无显著性意义,与白血病的易感性无相关性。研究未发现T349C,G470T及C500T变异。结论采用RT—PCRDGGE结合DNA测序法首次确定了儿童TS基因存在381A〉GcSNP位点,其等位基因频率为13.1%,基因型分布频率在AL患儿及正常儿童两组人群中差异无显著性。

  • 标签: 胸苷酸合成酶基因 编码区单核苷酸多态性 变性梯度凝胶电泳 急性白血病 儿童
  • 简介:在人教版高中《生物·选修3·现代生物科技专题》关于PCR的教学中,有几个问题会经常困扰教师和学生。下面就列举这些问题并作以解答。

  • 标签: PCR 生物科技 人教版
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  • 简介:目的探讨生殖支原体在非淋菌性尿道炎(NGU)/粘液脓性宫颈炎(MPC)中的发病情况。方法应用聚合酶链反应对236例STD门诊的非淋菌性尿道炎(NGU)/粘液脓性宫颈炎(MPC)患者泌尿生殖道标本进行了生殖支原体的检测。结果生殖支原体的阳性检出率为17.8%。结论生殖支原体在性病高危人群中有一定发病率,可引起非淋菌性尿道炎(NGU)/粘液脓性寓颈炎(MPC)。

  • 标签: 生殖支原体 PCR检测 NGU 粘液脓性宫颈炎 MPC
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  • 简介:1985年Cetus公司的Mullis发明的聚合酶链反应(PolymeraseChainReaction,PCR)是现代分子生物学研究中的一项非常重要的技术,它可在短时间内在试管中获得数百万特异DNA序列的拷贝,从而很容易地对目的基因进行分析、鉴定以及其它操作。这一技术现已广泛应用于生物学的各研究领域。PCR的定量实质是核酸的体外扩增,当人们利用技术扩增出大量的特异DNA序列后,还必须对这些PCR产物进行定性或定量检测,特别是临床检验中,定量分析PCR产物可以为临床诊断、疗效观察等提供更为准确的信息。另外,在研究基因的表达调控研究中,经常利用RT-PCR定量检测某一特定的转录mRNA,因此,建立灵敏、准确、重复性好的PCR产物定量检测法是目前PCR及其相关技术研究的特点,电是定量PCR技术的基础。本文将对这一技术近年来的研究进展状况作一简要综述。

  • 标签: RT-PCR定量检测 PCR产物 技术进展 分子生物学研究 定量PCR技术 DNA序列
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  • 简介:免疫PCR基本原理与ELISA相似,即用一段可扩增的DNA分子代替ELISA中酶放大检出信号,建立了直接免疫PCR的检测蓖麻毒素技术,实验结果表明,其灵敏度达1pg/ml,比ELISA方法灵敏度高10^3倍.

  • 标签: 蓖麻毒素 免疫PCR 戊二醛 生物素 亲和素
  • 简介:目的:用荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)法准确地定是检验血清中乙型肝炎病毒(HBV)的数量和免疫指标,以指导临床。方法:采用HBV-DVAFQ-PCR诊断试剂盒,以一种完全闭管式的PCR和荧光探针杂交技术组合所产生的实时检验定量PCR方法,检测了58例临床血清标本。结果:经FQ-PCR检测,9例HBV的HBsAg、HBeAg、HBcAg、HBcAb都阳性标本,其HBV-DNA的阳性率为100%,平均HBV-DNA拷贝数为2.0×10^8/ml;16例HBsAg、HBeAb、HBcAb都阳性的标本,其阳性率为62.5%(10例),平均拷贝数为5.2×10^5/ml,而常规PCR只有33%的阳性率;7例HBsAb、HBeAb、HBcAb都阳性的标本,其阳性率为14.3%(1例),平均拷贝数为4.7×10^3ml。结论:HBV-DNA的FQ-PCR检测较常规PCR更具有较高的灵敏度和特异性,且定量准确,结果可靠,能够避免PCR后处理导致物假阳性污染,可以真实反映HBV的感染和低复制状态,对于乙型肝炎的临床诊断,治病方案的选择和疗效观察有较大的指导意义。

  • 标签: 乙型肝炎病毒 荧光定量 聚合酶链反应 DNA HBV 假阳性污染
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  • 简介:摘要:本文介绍了PCR实验室设计的基本要求及不同布局设计,并着重强调设计过程中需要关注的重点。

  • 标签: PCR检测 工艺布局