转基因动物研究可应用于家畜遗传改良培育高产低耗优质抗逆新品种（系）；把转基因动物作为时空四维考察体系，可以研究基因功能和发育调控等基础生物学问题；也可籍此用作人兽疾病的实验模型，研究医学和兽医学问题；把转基因动物改造成为医用器官移植的供体，可取代人体器官的直接移植；把转基因动物开发成为活体发酵罐，可使动物象工厂一样根据工程设计的要求，生产预期的蛋白药物等高附加值的物质。但是，尽管对转基因整合、调控的规律有了基本的了解，但转基因动物制作效率低、定点整合困难所导致的转基因动物制作成本高和调控失灵，是制约当今转基因动物实用化进程的主要原因。动物克隆技术虽不能进行种质创新，但为种质创新效果的迅速放大提供了技术可能。根据目前的生命科学和生物技术的发展现状和趋势，动物转基因技术和动物克隆技术的有机结合既有迫切性又有必然性。转基因克隆动物技术在畜牧业上的应用前景也相当诱人，转基因克隆动物的研究将成为下一世纪国际范围内的生物工程领域的竞争热点。
